植物资源
五花顶自然保护区维管束植物分布种类有103科392属831种，其中国家Ⅱ级重点保护野生植物3种，分别是紫椴、黄檗和野大豆。
动物资源：五花顶自然保护区属于华北、东北动物区系交错带，兼有部分蒙新动物区系成分，区内分布有脊椎动物28目75科245种，其中哺乳类6目13科31种，爬行动物3目7科15种，两栖动物2目6科7种，鱼类3目5科35种；鸟类14目44科157种，其中国家I级保护野生动物有黑鹳1种，国家II级保护野生动物有26种，区内分布有辽宁省重点保护鸟类90种，兽类12种。是隼形目和鸮形目等猛禽的重要栖息繁殖地，也是东北亚候鸟南北迁徙重要通道。
其他资源
保护区是黑水河、六股河、狗河、石河、大风口水库和龙屯水库的重要水源涵养区，又是葫芦岛市西部的天然屏障，此区森林植被保护直接影响两个水库的蓄水和安全，是东戴河、绥中县、葫芦岛市乃至整个山海关区域人民生活用水和生态安全的重要保障。
